受到能登半島地震影響，日本有兩座核電站發生燃料池冷卻水溢出的情況。 營運新潟縣柏崎刈羽核電站的東京電力公司表示，在檢查位於核反應堆機組建築頂層的燃料池時，發現其中4個機組分別溢出0.46至600升的冷卻水，水中含有放射性物質，正檢測放射性水平，但指出目前未發現有冷卻水洩漏至核電站外，而冷卻水的溢出亦沒有造成損壞。 另外，石川縣志賀核電站也發生燃料池冷卻水濺出池外的情況。日本原子力規制廳表示，燃料池水溢出不會對燃料的冷卻產生影響，同時也沒有發現對外界造成影響。