我认为MIS的职位是相对较高的，并且可能技术含量不如程序员高，侧重的是管理和分析方面的能力。

CS的就业机会相对其它各类是相当高的，灵活性也强，从programmer到System Architect都有适合的位置。

MIS毕业之后，可能开始时就业会有较大难度。一旦找到对口工作，则职位会比较稳定。如果搞CS，技术上一直都要keep updated, 有的人觉得辛苦。

个人看法，仅供参考。